Optimalizované 3D zobrazovanie biologických objektov metódami röntgenovej mikrotomografie

(Riešiteľ: M. Hain)

Boli rozpracované optimalizované RTG mikrotomografické metodiky trojrozmernej  vizualizácie biologických objektov a ich vnútorných mikroštruktúr. Optimalizácia mikrotomografického merania pre konkrétny objekt zahŕňala voľbu materiálu terčíka, optimalizovaného urýchľovacieho napätia a prúdu RTG trubice, času akumulácie signálu na detektore, počtu opakovaní, voľby relaxačného času medzi dvomi meraniami  a počtu RTG projekcií. Významnou časťou optimalizovaného zobrazovania je oblasť digitálneho spracovania výsledkov mikrotomografických meraní a ich vizualizácie, kde boli rozpracované metódy filtrácie dát, renderovania a segmentácie obrazu.

Metodiky boli využité v spolupráci Prof. J. Klembarom z PriF UK pri komparatívnej anatomickej štúdii lebky beznohých jašterov Pseudopus Apodus [1] a Dr. Ľ. Vidličkom z Ústavu zoológie SAV pri popise anatómie novoobjaveného jaskynného švába [2].

 

Publikácie:

1. KLEMBARA, J. – DOBIAŠOVÁ, K. – HAIN, M. – YARYHIN, O. Skull anatomy and ontogeny of legless lizard Pseudopus apodus (Pallas, 1775): Heterochronic influences on form. In The Anatomical Record : Advances in Integrative Anatomy and Evolutionary Biology, 2017, vol. 300, no. 3, p. 460-502.
2. VIDLIČKA, Ľ. – VRŠANSKÝ, P. – KÚDELOVÁ, T. – KÚDELA, M. – DEHARVENG, L. – HAIN, M. New genus and species of cavernicolous cockroach (Blattaria, Nocticolidae) from Vietnam. In Zootaxa, 2017, vol. 4232, no. 3, p. 361-375.