Oddelenie optoelektronických meracích metód Vedúci: RNDr. Miroslav Hain, PhD., Zástupca: Ing. Vlado Jacko, PhD.
Oddelenie vývoja a inovácii prístrojovej techniky Vedúci: Ing. Vlado Jacko, PhD.
Oddelenie magnetometrie Vedúci: Ing. Ján Maňka, CSc., Zástupca: Mgr. Martin Škrátek, PhD.
Redakcia časopisu Measurement Science Review Vedúci redaktor: Prof. Ing. Ivan Frollo, DrSc.
Oddelenie teoretických metód Vedúci: RNDr. Anna Krakovská, CSc, Zástupca: Ing. Mgr. Roman Rosipal, PhD
Úsek ekonomiky a správy Vedúci: Ing. Mária Jusková Zástupca: Ing. Margita Juhanesovičová
Oddelenie zobrazovacích metód Vedúci: Dr. Ing. Pavol Szomolányi, Zástupca: Ing. Daniel Gogola, PhD.
Knižnica Katarína Kozáková
Oddelenie biomeraní Vedúca: Ing. Jana Švehlíková, PhD., Zástupca: Doc. Ing. Milan Tyšler, CSc.
Sekretariát riaditeľa Eva Gurišová